生物学论文_小管福寿螺SNP标记开发及其在物种
文章摘要:小管福寿螺(Pomacea canaliculata)是全球100种恶性外来入侵物种之一,对入侵地的经济和环境造成了严重危害.研究发现,入侵中国的福寿螺除小管福寿螺外,还包括斑点福寿螺(P.maculata).本研究基于全基因组重测序数据开发单核苷酸多态性标记(single nucleotide polymorphism,SNP)用于福寿螺的遗传多样性分析及物种鉴定.利用Sanger测序法对开发的22个SNP位点在浙江丽水小管福寿螺群体中进行遗传多样性分析,结果表明观测杂合度和期望杂合度范围分别为0~0.933和0.033~0.549,多态信息含量(PIC)范围为0.032~0.466.通过计算上述位点在小管福寿螺和斑点福寿螺之间分化指数(Fst)和等位基因频率,获得在两物种中存在明显差异的5个SNP位点用于物种鉴定.在30个小管福寿螺和18个斑点福寿螺样本中进行分型验证,结果表明,5个SNP位点单独使用时物种鉴定准确率均较高(>84.21%),当联合使用3~5个位点时准确率可达到100%.这些SNP位点将有助于福寿螺种群遗传学方面的研究以及小管福寿螺和斑点福寿螺高效、准确的物种鉴别。
文章关键词:小管福寿螺,斑点福寿螺,全基因组重测序,单核苷酸多态性位点,分子鉴定,
项目基金:国家自然科学基金项目(31770402),江苏省自然科学基金项目(BK2017407),中国藻业协会微藻分会第六届学术年会-大会报告I:微藻精准功能及应用-医药健康天然产物的生物合成.....作者:李福利中国藻业协会微藻分会第六届学术年会-大会报告I:微藻精准功能及应用-食用天然色素藻蓝的研发进展与展望.....作者:向文洲中国藻业协会微藻分会第六届学术年会-大会报告I:微藻精准功能及应用-裸藻、小球藻和雨生红球藻的健康功能及其生物制造研究进展.....作者:万民熙 中国藻业协会微藻分会第六届学术年会-大会报告I:微藻精准功能及应用-促进雨生红球藻虾青素积累的方法及机制初探.....作者:胡朝阳 中国藻业协会微藻分会第六届学术年会-大会报告I:微藻精准功能及应用-促进佐夫色绿藻高产虾青素的植物激素筛选与评价.....作者:陈俊辉中国藻业协会微藻分会第六届学术年会-大会报告I:微藻精准功能及应用-微藻氮素营养生长特征及其应用研究.....作者:张莹
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